En France : Au début des années 2000, une dizaine de prêtres et religieux sont mis en examen dans des affaires de pédophilie.  L'abbé René Bissey, sera ainsi condamné en 2000 à dix-huit ans de prison pour viol, et l'évêque de Bayeux et Lisieux, Mgr Pierre Pican, poursuivi pour non-dénonciation, sera condamné en septembre 2001 à trois mois de prison avec sursis. Le 20 septembre 2001, Bernard Mercury, un prêtre de 51 ans est condamné à quatre ans de prison par le tribunal correctionnel de Bordeaux pour des atteintes sexuelles sur huit enfants mineurs dont il s'occupait dans le cadre de ses activités à Pessac, dans la banlieue de Bordeaux. Les évêques de France mettent en place un groupe de travail multidisciplinaire sur la question. Mgr Bernard Aubertin, évêque de Chartres, préside ce comité consultatif en matière d'abus sexuel sur mineurs. Cette réflexion débouche en 2002, sur la publication d'un livre: "Lutter contre la pédophilie, repères pour les éducateurs".
En février 2009, un prêtre de Lille est écroué après avoir été dénoncé par un enfant de 13 ans avec lequel il correspondait sur Internet. L'homme de 39 ans a par la suite reconnu avoir eu plusieurs relations sexuelles avec des mineurs.

Aux Etats-Unis :
En février 2002, quatre-vingts prêtres du diocèse de Boston ont été accusés de pédophilie. L’archevêque de Boston, le cardinal Bernard Law, démissionne en décembre 2002, après avoir été accusé d’avoir couvert systématiquement les prêtres pédophiles.
Le pape Jean Paul II convoque alors pour la première fois les cardinaux américains.
Face à l'ampleur du scandale, l'Église catholique américaine rédige une Charte pour la protection des enfants et des jeunes, qui prévoit la suspension de la charge d'un prêtre dès la première accusation à son encontre, la saisine systématique de la justice civile et un accompagnement psychologique des séminaristes.
Les victimes sont dédommagées financièrement. Ces indemnités sont évaluées à près de 2 milliards de dollars (1,4 milliard d'euros).
En 2004, l’Eglise catholique américaine rend publique une étude réalisée par le John Jay College of Criminal Justice à New York révèle que 4.400 prêtres ont été accusés d’avoir agressé 11.000 enfants aux Etats-Unis, soit 4% de l’ensemble des 110.000 prêtres ayant été en fonction entre 1950 et 2002. Source et suite